M-Modul 4449: Genomanalyse für Masterstudierende – Sommersemester
Durchführung
6 Wochen ganztägig: 03.04.2023 – 12.05.2023 (Klausurtermin am 19.05.2023)
- vormittags: Vorlesung im ZIM, Raum 25.41.U1.22
- nachmittags: Übungen im ZIM, Raum 25.41.U1.22
Die Vorbesprechung mit endgültiger Platzvergabe findet am 30.03.2023 um 10:00 Uhr online statt.
Veranstalter
Prof. Dr. William Martin, Michael Knopp
Fragen und Kommentare bitte an .
Inhalte
- Untersuchungen zu Fragestellungen der molekularen Evolution anhand innovativer Techniken aus der Genomforschung.
- Bedienung und Arbeitsweise von Programmen und Programmpaketen zur Analyse molekularer Sequenzdaten (BLAST, Alignment, phylogenetische Stammbäume und Netzwerke, Bootstrapping, Clustering).
- Abruf und Auswertung von Information in biologischen Datenbanken.
- „Big data“-Analyse mit Hilfe der Programmiersprache Python.
- Einführung in die Programmiersprache Python (Syntax, Datenstrukturen, Kontrollstrukturen, Einlesen und Schreiben von Dateien), sowie Zusatzmodule für computergestützte Molekularbiologie (Biopython) und wissenschaftliches Rechnen (NumPy).
- Einführung in das Betriebssystem Linux und die Kommandozeile.
Der Kurs vermittelt sowohl theoretische Hintergrundinformationen als auch praktische Fähigkeiten. Die Studierenden führen praktische Übungen durch und diskutieren die Ergebnisse.
Veranstaltungshäufigkeit und Teilnehmerzahl
jedes Sommersemester
20 Plätze
Aufnahmebedingungen
Zulassung zum Masterstudiengang Biologie an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf; zentrale Platzvergabe über LSF.