M-Modul 4449: Genomanalyse für Masterstudierende – Sommersemester
Durchführung
6 Wochen ganztägig: 20.04.2020 – 15.05.2020 (Klausur am 29.05.2020)
- 09:30–12:00 Uhr: Vorlesung (in Raum 26.21.00.26)
- ab 12:00 Uhr: Übungen (im ZIM, Raum 25.41.U1.22)
Die Vorbesprechung mit endgültiger Platzvergabe entfällt.
Veranstalter
Prof. Dr. William Martin, Dr. Mayo Röttger, Michael Knopp
Fragen und Kommentare bitte an .
Inhalte
- Untersuchungen zu Fragestellungen der molekularen Evolution anhand innovativer Techniken aus der Genomforschung.
- Bedienung und Arbeitsweise von Programmen und Programmpaketen zur Analyse molekularer Sequenzdaten (BLAST, Alignment, phylogenetische Stammbäume und Netzwerke, Bootstrapping, Clustering).
- Abruf und Auswertung von Information in biologischen Datenbanken.
- „Big data“-Analyse mit Hilfe der Programmiersprache Python.
- Einführung in die Programmiersprache Python (Syntax, Datenstrukturen, Kontrollstrukturen, Einlesen und Schreiben von Dateien), sowie Zusatzmodule für computergestützte Molekularbiologie (Biopython) und wissenschaftliches Rechnen (NumPy).
- Einführung in das Betriebssystem Linux und die Kommandozeile.
Der Kurs vermittelt sowohl theoretische Hintergrundinformationen als auch praktische Fähigkeiten. Die Studierenden führen praktische Übungen durch und diskutieren die Ergebnisse.
Veranstaltungshäufigkeit und Teilnehmerzahl
jedes Sommersemester
20 Plätze
Aufnahmebedingungen
Zulassung zum Masterstudiengang Biologie an der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf; zentrale Platzvergabe.
Institutsleitung
Prof. Dr. William F. Martin
Molekulare Evolution
Heinrich-Heine-Universität
Düsseldorf
Universitätsstraße 1 Gebäude: 26.24
Etage/Raum: 03.072
Heinrich-Heine-Universität
Düsseldorf
Universitätsstraße 1 Gebäude: 26.24
Etage/Raum: 03.072
+49 211 81-13011
PostDoc
Dr. Mayo Röttger
Gebäude: 25.02
Etage/Raum: 02.34
Etage/Raum: 02.34
+49 211 81-12162