V-Modul 433: Perl für Biologen

Sollten Sie bei der Belegungsphase über LSF keinen Modulplatz mit fester Platzzusage bekommen haben, können Sie sich NACH Abschluss der Modulvergabe Frist 3 AUSSCHLIESSLICH über LSF für das Modul anmelden (ohne Platzzusage), so dass Sie auf die Warteliste gesetzt werden.

Durchführung

2 Wochen ganztägig: 22.01.2018  02.02.2018 (Klausur am 05.02.2018)

  • 09:30  11:00 Uhr: Vorlesung (in 26.21.00.26)
  • ab 11:30 Uhr: Übungen (im ZIM, Raum 25.41.U1.22)

Veranstalter

Prof. Dr. Martin, Prof. Dr. Lercher, Dr. Mayo Röttger
Fragen und Kommentare bitte an undefinedDr. Mayo Röttger

 

Ziele

Beginnend mit "Hello World" soll dieser Kurs Biologen die Automatisierung von sich wiederholenden Aufgaben – insbesondere in der Textverarbeitung (z. B. DNA-Sequenzen) – in einer Skriptsprache vermitteln. In der Bioinformatik ist Perl die am weitesten verbreitete Programmiersprache für den Umgang mit großen Dateien oder mit vielen kleinen Dateien. Die Sprache wird von Biologen weltweit eingesetzt und ist so essentiell für die Bioinformatik wie etwa Englisch für die Biologie. Mit Kenntnissen in Perl ist es möglich, aus großen Datenmengen Informationen schnell, gezielt und unkompliziert zu gewinnen. Zu Beginn wird eine Einführung in das Betriebssystem Linux gegeben. Dann folgt eine Einführung in den praktischen Umgang Perl, anhand konkreter Beispiele am Computer:

  • Ein- und Ausgabe von Text,
  • Datenstrukturen,
  • Kontrollstrukturen,
  • Schleifenanweisungen,
  • Lesen und Schreiben von Dateien.

 

Veranstaltungshäufigkeit und Teilnehmerzahl

jedes Wintersemester, 40 Praktikumsplätze

 

Aufnahmebedingungen

Abgeschlossenes Grundstudium.

Die Anmeldung erfolgt über LSF.

Es findet eine Vorbesprechung mit endgültiger Platzvergabe am 11.01.2018 um 10:00 Uhr in Raum 26.21.00.26 statt.

Institutsleitung

Prof. Dr. William F. Martin

Molekulare Evolution
Heinrich-Heine-Universität
Düsseldorf
Universitätsstraße 1
Gebäude: 26.13
Etage/Raum: 01.34
Tel.: +49 211 81-13011
Fax: +49 211 81-13554

PostDoc

Dr. Mayo Röttger

Gebäude: 26.13
Etage/Raum: 01.38
Tel.: +49 211 81-12343
Fax: +49 211 81-13554
Verantwortlich für den Inhalt: E-Mail sendenProf. Dr. William F. Martin