V-Modul 433: Perl für Biologen

Sollten Sie bei der Belegungsphase über LSF keinen Modulplatz mit fester Platzzusage bekommen haben, können Sie sich NACH Abschluss der Modulvergabe Frist 3 AUSSCHLIESSLICH über LSF für das Modul anmelden (ohne Platzzusage), so dass Sie auf die Warteliste gesetzt werden.

Durchführung

2 Wochen ganztägig: 11.06.2018 23.06.2018 (Klausur am 25.06.2018)

  • 09:30  11:30 Uhr: Vorlesung (Mo: 26.11.00.24, Di: 26.13.U1.11, Mi-Fr: 26.21.00.26)
  • ab ca. 12:30 Uhr: Übungen (im ZIM, 25.41.U1.22)

Veranstalter

Prof. Dr. Martin, Dr. Nicole Grünheit
Fragen und Kommentare bitte an undefinedDr. Nicole Grünheit

 

Ziele

Beginnend mit "Hello World" soll dieser Kurs Biologen die Automatisierung von sich wiederholenden Aufgaben – insbesondere in der Textverarbeitung (z. B. DNA-Sequenzen) – in einer Skriptsprache vermitteln. In der Bioinformatik ist Perl die am weitesten verbreitete Programmiersprache für den Umgang mit großen Dateien oder mit vielen kleinen Dateien. Die Sprache wird von Biologen weltweit eingesetzt und ist so essentiell für die Bioinformatik wie etwa Englisch für die Biologie. Mit Kenntnissen in Perl ist es möglich, aus großen Datenmengen Informationen schnell, gezielt und unkompliziert zu gewinnen. Zu Beginn wird eine Einführung in das Betriebssystem Linux gegeben. Dann folgt eine Einführung in den praktischen Umgang Perl, anhand konkreter Beispiele am Computer:

  • Ein- und Ausgabe von Text,
  • Datenstrukturen,
  • Kontrollstrukturen,
  • Schleifenanweisungen,
  • Lesen und Schreiben von Dateien.

 

Veranstaltungshäufigkeit und Teilnehmerzahl

im Sommersemester, 20 Praktikumsplätze

 

Aufnahmebedingungen

Abgeschlossenes Grundstudium.

DiePlatzvergabe läuft über LSF.

Es findet eine Vorbesprechung mit endgültiger Platzvergabe am 07.06.2018 um 10:00 Uhr in Raum 26.21.00.26 statt.

Institutsleitung

Prof. Dr. William F. Martin

Molekulare Evolution
Heinrich-Heine-Universität
Düsseldorf
Universitätsstraße 1
Gebäude: 26.13
Etage/Raum: 01.34
Tel.: +49 211 81-13011
Fax: +49 211 81-13554

PostDoc

Dr. Nicole Grünheit

Gebäude: 26.13
Etage/Raum: 01.28
Tel.: +49 211 81-14306
Fax: +49 211 81-13554
Verantwortlich für den Inhalt: E-Mail sendenProf. Dr. William F. Martin